regroupant 9 plateformes technologiques de pointe
La plateforme Histomics met à votre disposition un ensemble d’équipements ainsi que des postes de travail indispensables à la mise en œuvre de vos techniques d’histologie.
Tous les équipements ci-dessous sont accessibles en mise à disposition, formation et/ou prestation.
Comment venir travailler sur la plateforme ?
Inclusion en paraffine
Automate imprégnation
- MMFrance : STP120
Le STP120 est un automate de déshydratation de type carrousel destiné aux processus de fixation, déshydratation, clarification et imprégnation en paraffine des tissus qui permet de traiter jusqu’à 100 échantillons à la fois.
Différents programmes d’imprégnation sont possibles en fonction de la nature et de la taille de vos échantillons. N’hésitez pas à nous consulter.
Des consommables (Cassettes de différentes tailles, mousses, …) pour la préparation de vos échantillons sont disponibles au niveau de la plateforme.
Procédure Préparation Echantillon pour Inclusion Paraffine.
Toutes les imprégnations en paraffine doivent faire l’objet d’une demande de prestation.
Station enrobage
- Leica : EG1150 H+C
La station d’enrobage Leica EG1150 H+C est composé de 2 modules:
- Un module chauffé de distribution de paraffine d’une capacité de 3 litres, avec un plan de travail chauffé et spacieux et des zones de rangement pour les cassettes et les moules d’inclusion
- Une plaque froide
Coupe histologique
Cryostats
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Les lames anti-roll, rasoir et liquide OCT sont à disposition sur la plateforme. |
Microtomes à paraffine
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Bain-marie et plaque chauffante pour la récupération de vos coupes sont à disposition sur la plateforme ainsi que des étuves pour le séchage. |
Microtomes à congélation
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Microtomes à congélation équipés de système de refroidissement permettant le maintien de la température de la platine jusqu’à -40°C. Des tubes, plaques de cultures et autres contenants sont à votre disposition au niveau des microtomes. |
Vibratomes
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Des tubes, plaques de cultures et autres contenants sont à votre disposition au niveau des vibratomes. |
Colorations
La plateforme met à votre disposition un ensemble de colorants pour des colorations de type morphologique (eg HE, Cresyl violet, etc.) et d’autres pour l’identification de stigmates histopathologique (eg rouge Congo, thioflavineS etc.).
Immunohistochimies
10 postes (paillasses) de travail
La plateforme met à disposition un ensemble de réactifs pour la réalisation de vos immunohistochimies (ex : serum, BSA, anticorps secondaires fluorescents, système de révélation, DAB, Dapi, milieu de montage, …etc). Les anticorps primaires restent à la charge des utilisateurs.
N’hésitez pas à nous contacter pour discuter de votre besoin
Hybridation In Situ
Technologie RNAscope à haute sensibilité (kits de réactifs fournis par la plateforme à l’exception des sondes ARN)
Automate d’immunomarquages: Bond RX
De l’IHC à l’IF, en passant par le HIS et le multiplexage et bien plus encore, le BOND RX offre un moyen simple d’automatiser rapidement les analyses manuelles.
Le système BOND a une capacité de 30 lames, trois séries d’au plus dix lames chacune peuvent être traitées simultanément, avec différents protocoles si nécessaire, chaque série démarrant séparément afin d’assurer un traitement continu.
Transcriptomique spatial
GeoMx® DSP de NanoString
Le GeoMx® DSP (Digital Spatial Profiler) est un instrument de pointe en transcriptomique spatiale, conçu pour analyser les transcriptomes des régions d’intérêt sur des coupes de tissu.
Il est équipé d’un écran LED couleur 27″ 4K (8MP, modèle LG 27HJ712C-W) et de quatre filtres d’imagerie :
- FITC (525 nm)
- Cy3 (568 nm)
- Texas Red (615 nm)
- Cy5 (666 nm)
Cet équipement permet une analyse précise et détaillée des échantillons tissulaires.
Grâce à un million de micromiroirs intégrés, le GeoMx® DSP s’adapte à toutes les formes et tailles des régions sélectionnées sur le tissu. Ces micromiroirs dirigent la lumière UV vers les zones d’intérêt, déclenchant la photoclivage des sondes hybridées à l’ARNm.
Les oligonucléotides codés spatialement sont ensuite aspirés et collectés dans une plaque à 96 puits, permettant une analyse détaillée des transcriptomes.
Xenium de 10X genomics
La technologie Xenium de 10x Genomics permet l’analyse transcriptomique spatiale in situ à l’échelle cellulaire.
Elle offre une cartographie précise de l’expression des ARN directement dans les tissus, tout en conservant leur architecture.
Xenium combine la sensibilité de la transcriptomique avec la résolution spatiale d’une imagerie haute définition.
Elle permet la détection de centaines de gènes simultanément, sans sectionner ni dissocier les cellules.
Cette technologie est idéale pour explorer l’hétérogénéité cellulaire dans les tissus complexes.
Elle s’applique à de nombreux domaines : neurosciences, oncologie, immunologie, recherche translationnelle.
L’analyse spatiale fine permet de relier fonction cellulaire, localisation et interaction cellulaire.
Xenium est compatible avec des tissus frais congelés ou fixés (FFPE).
Notre plateforme propose l’accès à cette technologie de pointe, de l’échantillonnage à l’analyse.
CytAssist de 10x Genomics
Le CytAssist de 10x Genomics est un instrument clé pour la préparation des lames en transcriptomique spatiale Visium.
Il permet de transférer l’information transcriptomique d’une coupe tissulaire vers une lame Visium avec grande précision.
Cette étape est essentielle pour préserver l’intégrité morphologique du tissu tout en capturant l’expression génique.
Le CytAssist facilite le traitement d’échantillons délicats, notamment les tissus FFPE ou frais congelés.
Il standardise la préparation des échantillons, réduisant les erreurs humaines et augmentant la reproductibilité.
Transparisation des tissus
Méthode DISCO
La méthode DISCO permet de rendre les tissus biologiques transparents tout en conservant leur structure interne.
Elle repose sur l’utilisation de solvants pour clarifier des échantillons volumineux comme le cerveau ou la moelle épinière.
Cette transparisation permet une visualisation 3D en profondeur, sans avoir à sectionner le tissu.
DISCO est compatible avec l’immunomarquage et l’imagerie par microscopie à feuillet de lumière.
Elle permet d’observer les réseaux neuronaux, vasculaires et cellulaires dans leur intégralité.
N’hésitez pas à nous contacter pour discuter de la faisabilité de vos projets avec la méthode DISCO.
Acquisition
Station Mantra2 (camera multispectrale)
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Illumination : Fluorescence & lumière Transmise
Ojectifs : 4X – 10X – 20X Filtres : DAPI – FITC – CY3 – TXred – CY5 – 480 |
Axioscope
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Illumination : Fluorescence
Objectifs : 5X – 10X – 20X – 40X – 63X Filtres : DAPI – FITC – CY3 – CY5 |
Axioscope (double tête)
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Illumination : Lumière transmise
Objectifs : 5X – 10X – 20X – 40X – 63X Filtres : NA |
Strereomicroscope
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Illumination : Fluorescence & lumière Transmise Objectifs : 1X – 2X (avec grossissement de 0,73 à 12 fois) Filtres : DAPI – FITC – CY3 |
Scanners de lames
Axioscan Z1
Capacité : 100 lames
Illumination : Fluorescence & lumière Transmise
Objectifs : 2.5X – 5X – 10X – 20X – 40X
Filtres : DAPI – FITC – CY3 – CY5
Nanozoomer S60
Capacité : 60 lames
Illumination : Fluorescence & lumière Transmise
Objectifs : 20X – 40X
Filtres : DAPI – FITC – CY3 – CY3.5 – CY5
La formation est obligatoire avant toute utilisation des scanners. Comment faire une demande de formation ?
Microdissecteur laser
Leica : LMD7000
Le système de microdissection laser Leica LMD7000 permet à l’utilisateur de tracer facilement des régions d’intérêt pour la dissection et la collecte de cellules ou de zones tissulaires d’intérêt. Le laser est monté sur un microscope droit. Sur ce système c’est le laser qui se déplace, et non l’échantillon. Celui-ci tombe par gravité dans la capsule de réception ce qui permet d’obtenir des échantillons disséqués parfaitement coupés, exempts de contamination et prêts pour l’analyse.
La formation est obligatoire avant toute utilisation de cet équipement. Comment faire une demande de formation ?
Confinement L2
La plateforme possède un secteur de confinement L2 pour la manipulation d’échantillons « à risques » (eg tissu humain). Cet espace est équipé de :
- 1 cryostat Leica CM1950
- 1 vibratome Leica VT1000S
- 1 microtome à paraffine Leica RM2245
- 1 microtome à congélation MMFrance HM450 équipé d’une grande platine
- 3 postes de travail pour les immunohistochimies et/ ou colorations
- 1 poste de travail RNA FREE
- 1 loupe et 1 microscope en lumière blanche
- 1 sorbonne
N’hésitez pas à nous contacter si vous avez besoin d’informations complémentaires.
L’accès à ce confinement L2 est règlementé.
